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第110章基因敲除
林明和卡特琳娜吃过晚饭,相跟着向实验室溜达去。
卡特琳娜每天吃完晚饭要先睡一个小时再去实验室,以确保做实验时精力充沛,可今天有林明扰她,睡不成觉了,她只能端着一杯浓咖啡以备提神。
「如果你修习王瑜伽调息和制感,连站着都能打一个高质量的盹,多打几次盹,比喝咖啡强。」林明道。
「打盹还需要修习调息和制感?我每天从早上六点半忙到现在,中间不打盹早过劳猝死了。」卡特琳娜翻白眼道,「一天能见缝插针地打好几次盹。」
凡是从事高强度工作的人,一般都有自己调理放松的小妙招,没有小妙招的愣头青都会被早早淘汰掉。
「那倒不错。」林明点头,「不过打盹也有质量高低之分,拿我自己的体验来说,打一个几分钟的高质量盹能顶半小时的低质量睡眠。」
「修习调息制感不需要时间?哪有那时间。」卡特琳娜无奈道,「打盹还得瞅个空才能打呢。」
这话就没法儿再谈下去了,林明无奈闭嘴。
他和卡特琳娜虽然都很忙碌,他甚至比卡特琳娜还要忙,但他的时间大多可以自己主导,卡特琳娜的时间却不由她自己来主导,身为一个住院医,她随时都会被别人支配,这的确是很不同的。
这么溜达着,两人来到实验室。
实验室里灯火通明,但气氛不对。
陈清源丶布兰登丶戴维,还有一个林明没见过的新研究助理,四个人围在操作台前盯着一个平板屏幕,上面是一张测序峰图。
此外还有两个实验轮转研究生站在外围。
没人说话,空气像凝固了一样。
「陈教授。」林明轻声招呼了一声,「这是————」
「来了?」陈清源抬头看看林明和卡特琳娜,脸上连一丝笑意都挤不出来,声音沙哑,「基因敲除成功了————但耐药性一点没消失。」
(基因敲除,即把一个基因组的基因模块清除掉,然后看细菌会有什么变化,从而反向推导这个基因模块的功能。这是基因编辑研究工作中的一种重要研究模式。)
林明和卡特琳娜凑过去看着平板屏幕上的测序峰图,眉头皱起来。
他俩都明白,这对陈教授他们的课题意味着什么一如果能敲掉细菌的某个基因模块,让细菌不再耐药,那就证明该模块是耐药的关键,也是新药研发的绝佳靶点。
基因敲除这项工作做起来极其繁琐,需要设计「导航仪」gRNA,设计「剪刀」Cas9蛋白。
而敲除的过程也全是坑。
你可能会敲除错基因模块,可能敲除不乾净,等等,这都会影响到实验结果。
陈教授他们经过这一系列艰难工作,如今好不容易基因敲除成功了,但细菌的耐药性却纹丝不动!
这就意味着,他们苦苦寻找的那个「关键耐药模块」,根本不是目前敲除的这个!
陈教授叹了口气,指着屏幕上清晰的峰图:「我们设计的gRNA导航得很准,Cas9剪刀也剪得乾净,目标基因模块被完全敲除了,但细菌还是耐药。」
「这说明整个实验方向可能走偏了————」
「这是第三次了。」旁边的布兰登苦笑着摇了摇头,「前两次要么脱靶,要么敲除不完全。这次好不容易100%敲除成功,结果却是这样————」
「有没有可能,」林明谨慎道,「被敲除掉的这个基因模块的功能,被其他基因模块代偿了?」
「也有可能,」陈教授苦笑,「可这就需要更繁重的工作量了,现在这个课题的经费都成问题了,耗不起啊————」
实验室里再次陷入一片死寂。
林明和卡特琳娜也沉默着,心里很替他们难过,不知道再该说什么。
但同时,他们心里也悄悄松了一口气。
他们自己的课题即将进入机制研究,虽然也不容易,但比起陈教授这边,难度明显低了一大截。
陈教授的课题必须深入基因编辑层面,要做复杂的基因敲除—
他们要找到单个耐药基因当靶点,敲掉它→细菌不耐药=实锤,这是现代药的研发思路,不做敲除就无法坐实结论。
而林明他们研究中药复方,走的是完全不同的路:
不靠单一基因,而是靠多成分丶多靶点共同压制耐药性。
他们只需要观察细菌表型丶检测基因表达变化丶分析代谢通路,就能证明黄连解毒汤为何能延缓甚至逆转耐药。
「行了,今天就到这里吧,都累了,回去休息。」
陈清源靠在操作台边,揉了揉眉心道。
但没人动,所有人脸色都很沉重。
布兰登丶戴维,还有那位顶替卡特琳娜的新研究助理,心情比陈清源还要糟糕。
陈清源是PI丶是课题组负责人,经费来自项目基金,课题失利并不用自掏腰包,哪怕这个方向走不通,他也有资历和资源去申请下一个课题。
但布兰登他们不一样。
这次老板用了他们,下个课题未必还会选他们。
这意味着,他们很可能直接失去当前的科研岗位,学术上的晋升丶发文章丶积累成果的机会,自然也一并泡汤。
「不说我们课题了,你们那个课题进行到哪一步了?」陈清源问林明。
「正在做剂量梯度实验,今天查看结果。」林明道。
「那就查看吧?」陈清源道。
林明和卡特琳娜就打开饲养箱查看,布兰登和那个新的研究助理也过来帮忙。
查看结果,1:2浓度毒性太大,近三成蜡螟出现肢体僵硬;1:16浓度效果不明显;1:4
和1:8都有效,但1:8效果最好,存活率75%,而且蜡螟活力明显优于其他组。
这时,蒂莫西和刘伟也先后赶到了。
「咦~,这数据不错!头儿,咱们是不是可以进入机制实验了?」
蒂莫西和陈教授丶布兰登打过招呼,看了一下数据,兴奋地对林明道。
刘伟站在一边也是一脸兴奋。
「还不行,每组20只的样本量统计学效力依旧不足,只能算趋势参考,达不到定论标准。」
卡特琳娜摘下护目镜,指尖轻揉酸胀的眼尾,语气平静道。
「我觉得接下来,我们应该集中全部实验资源,做大样本重复验证实验,每组扩至30
只,设置四组平行对照,把药效数据做扎实,拿到统计学显着差异的结论后,我们再启动作用机制的探索实验。」
林明略做思索点点头:「行,就按你说的来。」
此时,他脑海中再次有淡金色的文字在世界线上浮现出来一【明医系统·科研辅助模块·药效验证抉择】
当前状态:药效预实验完成,待大样本确认。
A方案:每组30只+四组对照,率领团队14天内操作零失误完成,获得完美数据进入机制实验。
奖励:【机制靶点筛查直觉·入门→大成】
B方案:每组30只+四组对照,率领团队16天内完成,获得有效数据进入机制实验。
奖励:【机制靶点筛查直觉·入门→小成】
林明还是不假思索地选择了B项方案。
「行,你们这课题倒是越做越严谨了,就得这样,不要急于求成,要把数据做扎实,这比什么都重要。」
一旁的陈清源看着林明和卡特琳娜赞许地点头道。
「后面做到机制实验,有什么不明白的地方找我。」
他陈清源既然做了林明这个课题的共同PI,自然不能一直当甩手掌柜,前面验证预实验比较简单,用不着他,后面机制预实验时肯定地下场相助了。
「陈教授,这可避免不了,后面还得您来扛鼎的!」林明笑道。
「行,那我先走了,你们注意劳逸结合,也不要太赶时间,毕竟你们也有了一笔捐助资金,也不用太赶的。」陈清源说完先走了。
「咦~,林,你们拿到捐款了?」布兰登惊讶地问道,他还不知道这个消息。
戴维也不知道,此时猛地一眼看向林明,眼神里满是惊愕!
「嗯,前一段时间刚拿到一笔,不过也不多,临床实验的资金还得好好想办法筹措的。」林明低调地道。
布兰登还想问一下多少资金,话到嘴边终究没问,这个问题稍微有些敏感了。
但戴维忍不住问了出来:「拿到多少?」
「无可奉告。」林明直接道。
「嗤~,谁稀罕!也就三五万吧?牛什么!」戴维说着收拾起自己的东西走了。
「别介意,林,他就那样。」布兰登低声道。
「没事儿,布兰登,你看我这样忙,哪有时间理睬蚂蚱叫。」林明笑笑,「那不和你聊了,我们得开始忙碌了。」
「好,你们忙你们的,我也得回去了。」布兰登叹一口气,「只是我们这课题后面也不知道会怎样了,唉,太难了!」
那个新助理研究员和两个实验室轮转研究生也跟在他后面默默地走了。
实验室一时安静了下来,林明四人看着布兰登几人离去的疲惫和失望的背影,心里都有些不好受。
「但愿他们组能闯过这道难关,不然整个课题组都可能要解散了。」卡特琳娜低声道,「我们自己也要加把劲儿,但愿能顺利闯过大样本重复实验和机制实验。」
「但愿吧,我们的希望应该很大,毕竟我们的机制实验没有他们那么难。」林明道,」而且有陈教授把关。」
蒂莫西和刘伟没说什么,只感觉身上绷紧了一股劲儿。
然后四人明确分工,各自开始忙碌,为明日要启动的大样本重复验证实验做着准备。
林明统筹实验方案与质控节点,卡特琳娜整理数据表格与应急预案,蒂莫西调试仪器并校准基线,刘伟覆核试剂配比与样本编号。
从晚上九点忙到十一点,试剂配平丶仪器预热丶流程预演逐一落地,实验室里原本压抑的氛围,被踏实笃定的干劲彻底冲淡。